密云区第二小学前身为“白檀书院”，始建于明朝万历二十二年（1594年），重建于清道光十四年（1834年），距今已有186年的历史。学校先后被评为北京市中小学党建示范点、北京市五星级党支部、北京市先进职工小家、北京市艺术教育、科技教育示范校；2012年8月入选北京市首批33所百年学校。2013年被评为北京市首批校园文化示范校。
密云区第二小学一向重视精神文明建设工作。近年来，学校坚持“强保障，引领发展把方向；强政治，思想引领铸师魂；强队伍，立德树人担使命；强旗帜，党员文化铸先锋”。“四维一体”扎实推进精神文明建设工作，尤其是注重教师的师德建设工作，多种路径引领师德工作向前发展。提出把塑造“师德高品质、专业高学识、发展多角度、能力多方位、目标专业化、视野国际化”作为教师队伍建设的培养目标，为这所百年老校续写历史的荣光。
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